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研究进展
陈铭教授实验室本科生参与发表Bioinformatics论文
2016-11-01
浙江大学生命科学学院中文网
实验室开发了一种新的基于内共生学说的代谢网络空缺填补的方法（DEF），用于高精度的代谢网络空缺填补。通过系统生物学的方法和实验手段对网络进行精细的修正和评估，包括化合物胞内价态的计算，反应方程式的配平，反应可逆性的预测，空缺的查找及填补。该成果以“DEF: An automated dead-end filling approach based on quasi-endosymbiosis”为题发表在《Bioinformatics》（IF=5.766）。该论文第一作者为刘丽丽博士，...
于明坚教授实验室在Scientific Reports发表论文
2016-10-27
浙江大学生命科学学院中文网
中国亚热带地区，作为世界亚热带森林主要分布区，目前森林内物种组成和群落结构普遍被人类活动所干扰。环境过滤和扩散限制作为影响群落构建的主要过程，而其在原始林和次生林中所起的相对作用尚不清楚。该研究同时结合物种beta多样性(taxonomic beta diversity, TBD)和系统发育beta多样性(phylogenetic beta diversity, PBD)指数方法，其中系统发育beta多样性计算包含了平均最近邻体系统发育距离(terminal PBD, PBDt)和平均...
陈欣/唐建军教授实验室在Journal of Ecology上发表论文
2016-09-23
浙江大学生命科学学院中文网
丛枝菌根真菌 (Arbuscular mycorrhizal fungi, AMF) 是一类能与80%以上陆生植物根系形成共生关系的土壤真菌。研究已发现，AMF多样性可影响植物群落的多样性与生产力，但其影响机理一直未得到解释。我们的研究发现， AMF多样性对宿主植物的效应在物种水平 (Species level) 物种丰富度表现为冗余效应，而在科(Family level)的分类学水平上，科的丰富度表现为互补效应。该研究成果以题为“Taxonomic resolution is a determinant...
植物所郑绍建教授实验室在Plant Physiology上发表论文
2016-09-22
浙江大学生命科学学院中文网
铝毒是限制酸性土壤作物生长的主要因素。揭示植物铝毒和耐铝机制，克隆和鉴定关键耐铝基因，通过生物工程手段提高植物耐铝能力，是提高酸性土壤生产力提供的重要基础。在前期研究中，我们从农作物饭豆中克隆和鉴定了一个受参与耐酸铝的重要基因VuFDH（Vigna umbellata Formate Dehydrogenase）。超表达VuFDH转基因植物适应酸铝环境的能力大大增强 （Lou et al., 2016 Plant Physiology 171: 294-305）。根据甲酸盐的可能来源...
丁平教授实验室在Global Ecology and Biogeography发表论文
2016-08-22
浙江大学生命科学学院中文网
小岛屿效应（the small-island effect）是岛屿生物地理学研究中重要的前沿研究领域之一。它是指当岛屿面积小于某一特定面积阈值时，物种数不随面积增大而增大的格局。目前小岛屿效应研究中一个严重缺陷是没有将无物种分布的岛屿（S = 0）考虑在内。因此，关于无物种分布岛屿对小岛屿效应影响的普遍性及其影响因素还不清楚。本研究通过对全球尺度278个无物种分布岛屿数据小岛屿效应的分析，首次系统研究了无物种...
程磊教授实验室在《Ecology》发表论文
2016-08-01
浙江大学生命科学学院中文网
达尔文在《物种起源》一书中指出，一切生物为了生存（struggle for existence）必须依靠外部的生物或非生物环境，并与其形成一定相互关系；理解生物的生存与繁衍方式是理解自然选择(natural selection)理论的基石。同样在自然界，植物为了获得可持续发展与繁衍，在其漫长的进化历史中，发展出一系列生存策略。比如，为了适应陆地生态系统有效养分匮乏状况，绝大多数植物与一些真菌（如丛枝菌根真菌）形成成互惠互利...
植物所郑绍建教授实验室在Plant Physiology上发表论文
2016-05-20
浙江大学生命科学学院中文网
铁是植物必需的微量营养元素，而在碱性/石灰性土壤上由于有效铁含量水平不能满足植物正常生长需要，很易出现缺铁而导致的新叶失绿现象，从而严重影响农作物生产的正常生长，并导致减产减收和影响农产品的营养品质。世界上大约有30%左右的可耕地属于碱性/石灰性土壤，我国北方和沿海地区也广为分布。耐缺铁的植物可通过诱导特异的根系形态和生理生化特性来提高根系对土壤中铁的活化能力和吸收能力，但对植物是否可通过提高铁在体内...
傅承新/邱英雄植物系统进化研究室在Scientific Reports发表论文
2016-05-10
浙江大学生命科学学院中文网
历史与当代的地理和环境因子如何在不同的进化尺度上影响物种的空间遗传分化一直是分子与进化生态学研究中的核心科学问题之一，但迄今为止还没有得到很好的研究。中国亚热带植物区系保存有丰富的第三纪孑遗成分，由于这些孑遗物种分布于环境与景观异质性明显的山地，因而成为开展此类研究的一个极佳系统。本研究组选择广布于中国亚热带山地的特有第三纪孑遗森林树种香果树（Emmenopterys henryi）为研究对象，基于多位点的序列与基...
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