生态学学科于1983年获得硕士学位授予权，1991年获得博士学位授予权，2001年被教育部批准为国家重点学科，2016年入选浙江大学高峰学科建设计划、海外一流大学伙伴提升计划，2017年入选国家“双一流”建设学科，2022年再次入选国家“双一流”建设学科，在教育部学科评估中被评为A+学科。在ESI排名中，与本学科相关的环境与生态学、植物与动物学研究领域已进入全球前1‰。

学科现有专任教师49人，其中国家级杰出人才14人、国家级优秀青年人才10人。多位教师在国际高水平期刊担任副主编或编委。

学科依托国家濒危野生动植物种质基因保护中心和生命系统稳态与保护教育部重点实验室等国家和省部级平台，聚焦生物多样性保护，“双碳计划”和生物安全等国家战略，重点在动物生态学、植物生态学、微生物生态学和生态系统生态学四个二级学科开展前沿与交叉研究，近五年发表高质量学术论文90余篇，其中《自然》2篇、《科学》1篇；承担国家级项目100余项。获国家科技进步二等奖4项，教育部科技进步和自然科学一等奖各1项。