2019年9月11日至9月17日,第四届浙江大学研究生国际工作坊项目生命科学海外研习工作坊师生交流团8人由陈铭教授带队赴德国比勒菲尔德大学开展访问交流。项目开展于7月浙江大学-比勒菲尔德大学生物信息学联合学术研讨会顺利召开之后,促进了双方生命科学领域更深层次的交流了解,为进一步建立两校长远合作奠定了基础。

访问第一天,师生们在比勒菲尔德大学基因组测序平台主任Joern Kalinowski教授带领下参观了学校的生物技术中心(CeBiTec)。该技术中心配备了包括基因组、转录组测序(Illumina、Nanopore等测序仪),蛋白质组和代谢组分析(ThermoFisher全自动质谱仪、MALDI-MS质谱仪)等一系列生命科学研究平台,实现了大部分生物学实验数据获取和分析一体化。Kalinowski教授详细介绍了各个分析平台的基本结构组成、主要工作原理以及平台正在进行的一些研究项目。Kalinowski教授特别介绍了MinION小型纳米孔测序仪,体积比手机还要小,可以直接连接电脑甚至手机进行实时测序过程监控和数据收集,极大地方便和简化了研究人员获取测序数据的实验过程。期间学生们对一些仪器产生了浓厚兴趣(例如一次测序的通量大小及所需时间等),与Kalinowski教授展开了讨论交流。

访问第二天,比勒菲尔德大学国际交流处专职博士后黄立人博士及生物信息学Ralf Hofestaedt教授带领师生们参观了整个比勒菲尔德大学校区,介绍了整个学校的教育模式、学院结构分布等。当天恰为当地农历八月十五,故参观结束后德方老师与我院师生共同品尝了月饼庆祝中秋。

9月16日,双方共同举办了生物信息学联合学术研讨会。我院陈铭教授及博士生和比勒菲尔德大学CeBiTec生物技术中心5位教授及博士后、博士生参加。研讨会上,比勒菲尔德大学CeBiTec中心执行委员Jens Stoye教授作了开幕致辞并介绍了他关于比较基因组序列分析算法的研究工作。Tim Nattkemper教授及其学生作了关于MALDI成像数据在线可视化的主题报告及演示。Joern Kalinowski教授介绍了基因组学在医药及生物技术产业领域的应用。我院学生各自报告了有关生物数据库工具检索分析引擎、肿瘤异质性分析、阿尔兹海默症基因网络及通路挖掘、植物环状RNA挖掘和功能预测、基因组重复序列定量分析、CNN预测蛋白质互作关系及神经退行性疾病相关蛋白网络数据库等领域的研究成果,现场交流讨论氛围活跃。此外,比勒菲尔德大学Nils-Christian Lubke博士介绍了该校iGEM团队的历史及成果,与我校iGEM指导老师陈铭教授进行了深入交流讨论。随后双方教授就进一步合作的相关事项及进度进行了讨论磋商,收效显著,推动了双方深入合作的进程。



访问第四天,恰为比勒菲尔德大学建校50周年,我院师生共同参与体验了学生节庆典,融入到当地学生庆祝校庆的氛围中。期间一辆绿色的移动测序车引起了大家的兴趣,原来是Joern Kalinowski教授将实验室的便携式手持测序仪带到了学生节现场,给学生介绍新式的测序设备。师生们对这样推广生命科学领域最新技术的方式表示了赞同,通过与更多不同学科专业的学生展示和交流完成生物学知识的传播。

此外在访问期间,Joern Kalinowski教授特别介绍比勒菲尔德大学的iGEM团队,该队伍在国际赛场上持续得到过多项金牌和前三名荣誉。陈老师还专门对比勒菲尔德大学10年来的iGEM参赛情况与浙江大学iGEM团队进行了对比讨论,并分享了彼此在指导学生队伍包括构思选题、项目实施、评估、比赛方面的经验,以及各自带队参加iGEM国际竞赛的独到见解。(图为两位指导老师在iGEM成果展示橱柜处合影)

本次生命科学海外研习工作坊交流团成员收获颇丰,不仅拓宽了国际视野,更通过研讨会和参观研习在学术科研水平上提升了认知。同时浙江大学-比勒菲尔德大学生物信息学联合学术研讨会的再次开展也进一步加强了学院与比勒菲尔德大学的交流合作,推动了生命科学学院的双一流建设进程,深化了两校建立长远合作的方向和目标。
生命科学学院
2019年10月9日