教学建设
5年来，基地在教改方面做了许多尝试.基地共设立了2项教育部基地名牌课程建设、6项省（部）级和18项校级教改项目,
范围涉及数、理、化、外语及生物学各基础课程，提出了从课程体系,
教学内容、方法、手段和实验内容等多方面的改革设想并开始实施。有些课程，如生态学和细胞生物学，还专门去国内兄弟院校学习调研，以提高教学质量。
动、植物学
重在直观形象教学改革，建设多媒体显微示教系统，切片技术的实验实行开放式。
植物生理学
着重改革实验内容和实验方法，双语教学，实行开放式实验。以小论文代替实验报告，99及01年两次被教育部定为名牌课程建设。
微生物学
注重直观形象教学，建设多媒体显微示教系统，编写省重点教材，建设名牌课程——微生物分子生物学的建设工作正在进行。
生物化学和分子生物学
强调实验内容的更新和衔接，编写新的实验指导书和多媒体课件，实行双语授课以提高课堂效果。
生态学
增加了野外实习的内容，使学生对课堂内容有了进一步理解。
遗传学和生物技术导论
不断补充学科新进展方面的教学内容和实验方法。
外语
从2年级开始，开设了口语课和专业英语课，部分请外籍老师担任，取得了良好效果，基地班多次在全校性英语演讲和作文比赛等活动中获奖；同时英语4-6级通过率名列校区第一，也为4年级专业课实施英语教学打基础。
基地注重学生学习生物学基础理论，恢复和增加了“进化生物学”、“保护生物学”、“生物信息学”和“基因组学”等生物学热点课程。设立生物科学研究技术课程，以开放和半开放式，由学生结合模块进行自由选择，在动物、植物、微生物、生化、生态等研究实验室进行，取得了良好效果。通过发酵工程、细胞工程、基因工程和生物信息实验室的建设，为基地班开设了各技能选修课，实现了基础与实践的良好结合。
在教改成果方面，《分子生物学课程建设探索与实践》获97年教育部教学成果二等奖，《遗传学教学改革与实践》获97年浙江省教学成果二等奖，《生命科学导论的改革与实践》获2001年教育部国家级教学成果二等奖。同时，近年还发表教学论文多篇。
教材：《微生物学》、《遗传模型分析方法》、《实用统计分析》、《植物生理学》、《植物学》《生态学》、《经济微生物学》、《植物分子生理学》、《核农学》、《有机化学》等。
实验指导：《植物生理学实验指导》、《微生物学实验指导》、《动物学实验指导》、《植物学实习指导》等。
课件、电视教材：参编了《生命科学导论》和农业院校的《动物学》；完成或出版了《中国生态农业》电视教材、《植物学》和《生命科学导论》的多媒体教学课件。各门课程都编写和利用多媒体课件教学，以利于提高了教学效果，也增加了基地向国内其他院校的辐射作用，如《植物学》和《生命科学导论》已由多所学校购买使用。
5年来共安排了12名教师出外进修, 包括赴英美进修英语教学、植物生理、基因组学、微生物分子生物学，为双语教学打基础。目前，已有4门专业课“分子生物学”、“植物生理学”、“神经生物学”和“生物信息与数据处理”实行完全双语教学，使用英语讲义；大多数课程开始了部分双语教学；“生物信息与数据处理”课已使用英语原版教材和英语为主的教学方法。
整个基地约80%的教授、副教授坚持在教学第一线。5年中，为基地开设的91门（次）基础和专业基础课程中，100%达到由高级职称的教师担任，正教授担任主讲的将达到50%，其中主干课程教授主讲率达80%；5年中，我们尽可能安排各学科的优秀教师担任基地的主讲教师。